小美超声聚能式超声波DNA打断仪在测序公司的应用

  • 产品介绍

XM-Q800R3聚能式超声DNA剪切仪是小美超声公司是国内最早为CHIP实验(染色质免疫共沉淀---一种研究蛋白与DNA相互作用的技术)而设计的,整套设备由一体式主机、聚能式换能器、杯式探头、样品支架、可透视消音箱和冷却水循环机等几个部分组成。经二代测序仪Illumina厂家实验室测试使用,设备的性能和实验结果非常完美,媲美进口产品。

全基因组测序(Whole Genome Sequencing, WGS)是基因组最为全面的研究方案。WGS通过对人类细胞中的基因组(包括线粒体)所有的30亿碱基进行测序,测定其DNA的碱基序列,从而可在全基因组水平上检测与人类疾病相关的单核苷酸变异(SNVs)、插入缺失(In Dels)、拷贝数变异(CNVs)和结构变异(SVs)等多种全面的突变信息,进而得到完整的人体“说明书”。XM-Q800R3打断仪为全基因提供高效、均一、稳定的样品前处理。

  • 应用公司介绍

希望组(Grandomics)是三代测序大数据技术和应用的开拓者,成立于2011年8月8日,曾用“未来组”品牌开拓三代测序科技服务,是三代测序服务公司和三代测序大数据诊断公司。

多年来,一直专注于在三代测序平台上进行技术开发与应用拓展,目前,已经形成了“科技服务”、“医学诊断”、“生物信息”、“先进制造”四大业务模块;在北京、武汉建设了合计超过5,000平米的科研服务平台、医学检验实验室;引进了国际先进的ONT PromethION 48、PacBio Sequel II、MGISEQ2000/T7、Bionano Saphyr光学图谱等技术平台。

非接触式DNA打断是全基因组测序的前处理步骤,打断效果是否均一、稳定、高效影响后续全基因组序列的准确性。测试阶段客户使用参数为:4℃循环水。100%功率,运行10s,停止10s,15分钟打断效果如下图:agilent 2100测试结果表明时间过长,均一性不好。

经过调整后,效果提升。

10分钟效果图
11分钟打断效果图

根据片段大小,可以调整不同的实验时间和功率。

  • 应用展望

   全基因组测序基本上在所有三代测序这个都有大范围的应用,我司非接触式DNA打断仪有多种通量和效率可以选择,XM-Q800R3是目前效率最高,但是通量较小的一款设备,通过与未来组的合作应用,我们将加速研发改进设备的应用,更加完美地匹配到全基因组测序的服务中。

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