上海复旦附属中山医院引入了小美超声高通量声波基因组剪切仪XM-M18A,针对提取的DNA样本开展片段化实验,通过多梯度超声程序与低温控温技术,探索不同浓度样本的最优打断条件,力求将DNA精准剪切至150-200bp区间,为后续测序实验提供了高质量的样品前处理方案。
客户信息:复旦附属医院(中山医院)
实验目的:对提取的DNA片段进行打断处理,使其打断到150-200bp区间,后续方便做测序实验。
实验仪器:小美超声高通量声波基因组剪切仪 XM-M18A

高通量超声波基因组剪切仪对DNA片段打断的实验步骤:
1、打开主机是XM-M18A(带有医疗证书)及冷水机,设置冷水机温度2℃。
2、将EP管加入浓度为14 ng/μL、12.75 ng/μL、12.3 ng/μL、11.5ng/μL的DNA溶液。
2、将3管装好样品的EP(低吸附管) 管分别放入仪器的适配器当中,配平。
3、程序设置:超声工作时间20s 间隔时间10s,总时长分别10分钟、15分钟、20分钟、25分钟、(个别30min),四个梯度对比。
4、程序结束后,取出样品使用毛细电泳进行基因组片段化检测。
6号样品14 ng/μL(6-3最佳 20min、25min、30min)



7号样品12.75 ng/μL(7-4 最佳10min、15min、20min、25min)




8号样品12.3 ng/μL(8-2 最佳15min、20min、25min)



9号样品11.5ng/μL(9-1最佳15min、20min、25min、30min)




实验注意事项:
1、提前15分钟将三款仪器的冷水机启动,设置温度为2℃
2、试用TPX材质的EP管,管子的材质影响超声打断效果。