在NGS检测实验中,DNA文库构建的第一步就是将DNA随机打断成符合各测序平台读长的片段。相信熟悉NGS文库构建的科研人员一定纠结过这个问题,是用酶解打断还是超声波打断?
目前DNA打断的主要的方法是超声法和酶解法。但是这两种方法在实际使用中各具优势,需要根据实验者自身的情况进行选择。
超声波打断法:
1.操作简单,耗时短,成本低;
2.剪切效果不受DNA浓度影响,
3.随机片段化,无GC序列偏好;
4.片段化结果集中度高,目的长度片段得率高。
酶解法:
1.实验要求严格,针对不同样本合适的片段化条件摸索不易,成本较高;
2.存在序列偏好性;需要根据样本浓度改变酶浓度,酶活性易受到溶液成分影响;
3.目标长度片段集中度较低。
由上可见超声打断法的优势显而易见,但常用的超声波打断仪分为接触式和非接触式。相比传统的探头超声波破碎仪,探头与样品直接接触,一次只能处理一个样品,实验周期长。而小美非接触超声波DNA打断仪产品却可在密闭容器下进行破碎,不产生感染性飞雾,超声探头与样品不接触,避免交叉污染。
对于每天要处理多个样品或者贵重样品的实验室,小美非接触DNA超声波打断仪具有通量高、实验一致性好,实验重复性好、片段得率高、样本低损耗,无交叉污染等优点。
一次多可同时处理32-64个样品,实验效率高。专为二代测序DNA样本与染色质免疫共沉淀实验样本前处理量身订做的。
采用等温、非接触的方式对样品进行打断、匀浆和混合;可用于超微量破碎,隔着离心管能打断染色体。深受各大基因公司、生物公司、测序公司的好评!
如何做好一个实验,选择往往比努力更重要。小美非接触超声波DNA打断仪,让你实验事半功倍的科研好物!